Suite à la série précédente "Aria the animation", Akari Mizunashi (future Undine) continue son travail pour devenir gondolière professionnelle, accompagnée des ses amies, Aika et Alice. Durant leurs voyages, elles seront emmenées dans de mystérieuses aventures tout en faisant la rencontre de curieux personnages dans la douce et paisible ville de Néo Vanezia.
