L'histoire se déroule en 1999 dans une école privée japonaise assez réputée, surnommée l'Académie Occulte à cause des nombreux phénomènes paranormaux s'y déroulant.Kumashiro Maya, la fille du directeur de l'établissement intègre l'école suite à la mort de ce dernier. Par la suite, un jeune homme très étrange nommé Fumiaki Uchida apparaît soudainement et déclare avoir remonté le temps depuis 2012 afin empêcher un terrible événement s'étant produit à son époque.
