Takumi Fujiwara a accepté la proposition de Ryosuke et fait désormais partie de la team Project D. La team compte seulement 2 pilotes, Takumi et Keisuke. Le but de Project D est d'effectuer des courses à l'extérieur de leur préfecture afin de faire valoir leurs exploits. Ils établissent des records de temps sur chaque course qu'ils diffusent ensuite sur leur site internet. C'est Ryousuke qui gère entièrement la team. Takumi au volant de son AE86 est assigné aux courses de déscente pendant que Keisuke et sa FD3S s'occupe des courses en montée. Tous deux apprennent énormément grâce aux nombreux conseils de Ryousuke ainsi qu'aux différentes courses, plus difficile les unes que les autres.
Aucun pilote n'égale la team Project D, excepté avant qu'une mystérieuse Subaru Impreza WRX Type R Version V fasse son apparition...