Dans un avenir lointain, l'humanité a étreint le système Fractale comme le sentier ultime vers l'utopie. Composé de plusieurs trillions d'ordinateurs interconnectés, Fractale a été créé au XXIIème siècle pour promouvoir un style de vie pacifique pour le monde entier dans l'échange d'une récupération périodique d'information nominative des individus par les terminus trouvés dans leurs corps. Vivant dans une région de côte rocheuse, Clain est un jeune garçon passionné par la vieille technologie. Après avoir aidé une fille appelé Phryne, elle lui donne un pendentif puis disparaît le matin suivant. En accédant aux données du cadeau particulier, Clain finit par réussir à convoquer un avatar sous la forme d'une petite fille appelée Nessa.
Ensemble, ils commencent un voyage pour découvrir la vérité derrière le système Fractale.
L'histoire se déroule sur une île, où "le Système de Fractale" commence à s'effondrer.
