Tokidoki est un lycéen japonais envoyé au musée d'histoire naturelle de la région après avoir raté son cours d'histoire. Ce musée high tech recrée virtuellement la période Edo.
Sur place, il est attaqué par deux êtres supernaturels connus sous le nom The Nue & The Yakou. Il perd l'usage de son œil gauche dans la bataille. Après avoir été sauvé des griffes de ses assaillants par Kuchiha, Tokidoki réalise qu'il n'est plus dans un monde virtuel mais dans l'ère Edo...
