"La fille du ciel" une légende basée sur une fille qui posséderait une paire d'ailes dans le dos et qui parcourrait la voûte céleste. Tout cela paraît telle une fable, un conte de fée mais pour la famille Kunisaki, c'est une réalité qu'elle poursuit depuis des générations passées. Yukito Kunisaki est un vagabond qui erre de lieu en lieu cherchant à gagner un peu d'argent pour se nourrir en usant de son talent de manipuler une marionnette magique et cela sans fils. Le jeune suit en réalité les traces de sa mère ayant recherché "la fille du ciel" durant toute son existence. Durant son voyage, il atterrit dans un petit village au bord de la mer, où il rencontre une jeune fille un peu naïve appelée Misuzu, dont le rêve le plus cher est très particulier : son désir est de pouvoir s'envoler. Par la force des choses, Yukito se retrouve à s'occuper de Misuzu et décide de rester au village. Les événements qui se dérouleront devant son regard par la suite seront en fait l'écho d'une histoire qui dure depuis déjà des milliers d'étés ...