L'histoire se déroule dans un univers alternatif. Le 19 avril 1973, les premiers BETAs, créatures extra-terrestre colonisant jusque là la Lune, atterrissent sur Terre. Peu à peu, elle se répandent sur la planète en massacrant tous ceux qui se trouvent sur leur chemin et en établissant des "nids". Juillet 1998. Après avoir mis une bonne partie de l'Asie et de l'Europe à feu et à sang, les BETAs débutent leur offensive contre le Japon en commençant par Kyushu. Peu à peu, l'archipel est conquis et un nouveau nid, le 21è, est érigé à Sadogashima. Sayoko Komaki, à l'époque jeune pilote avec peu d'expérience, a assisté à la chute de la base de Sado. Une expérience traumatisante au cours de laquelle elle a malgré tout assisté à un miracle : le sauvetage d'une jeune civile.