L'histoire se déroule dans un futur proche (fin du XXIè siècle - début du XXIIè siècle).
Les humains quittent peu à peu la Terre afin de vivre dans l'espace, installant des colonies en des lieux qui leur semble propices.
Afin qu'ils puissent mieux s'adapter à ce nouveau milieu, des enfants font l'objet du projet MJP. Ces derniers sont génétiquement modifiés afin d'être des formes de vies adaptées pour la vie dans l'espace.Izuru Hitachi est, comme les autres membres de son équipe, un de ces enfants. Étudiant à Grandzehle, dans le but de devenir un officier militaire, il est membre de "Team Rabbit", la pire équipe de toute l'Académie. Cependant, c'est Izuru et son groupe qui seront choisis pour aider à l'évacuation de la base Undinia, submergée par le feu ennemi.
En effet, depuis plusieurs année, l'armée humaine combat une force alien humanoïde hostile.